司马迁将项羽写入《项羽本纪》，并不完全是因为刘邦曾向项羽称臣五年。司马迁在《项羽本纪》中记载了项羽的生平事迹，包括他的崛起、反秦斗争、楚汉战争以及最终的失败。司马迁对项羽的评价颇高，认为他是一位英勇无畏、具有领导才能的人物，但同时也指出了他的一些缺点和错误，如刚愎自用、缺乏政治智慧等。

司马迁将项羽列入本纪，主要是因为他认为项羽在秦末汉初的历史中具有重要地位。尽管项羽没有最终成为皇帝，但他在推翻秦朝、建立西楚政权的过程中发挥了关键作用，其统治时期的政治、军事和社会状况对后世产生了深远影响。

此外，司马迁的历史观较为客观，他注重记录历史事实，而不拘泥于传统的体例和观念。他认为项羽的事迹值得被详细记载和评价，因此在《史记》中为他设立了本纪。这种突破传统的做法也体现了司马迁对历史的独特见解和对人物的全面认识。